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    什么是基因編輯技術(shù)?(下)

    發(fā)布時(shí)間: 2024-06-05  點(diǎn)擊次數(shù): 289次

    四、轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)因子核酸酶技術(shù)(TALEN)

    轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)(Transcription Activator-Like Effector, TALE)核酸酶(Nucleases, TALENs)是一種基因編輯工具,其工作原理與鋅指核酸酶(ZFNs)類(lèi)似,但是它們使用不同的DNA結(jié)合蛋白。TALEN是一種人工制造的蛋白質(zhì),由兩部分組成:一個(gè)DNA結(jié)合域(TALE)和一個(gè)FokI核酸酶。


    1、TALE DNA結(jié)合域

    TALE蛋白是由植物病原體Xanthomonas細(xì)菌產(chǎn)生的,它們可以識(shí)別并結(jié)合到植物基因中的特定序列,進(jìn)而改變植物的基因表達(dá)。TALE蛋白的DNA結(jié)合域由多個(gè)重復(fù)的氨基酸序列組成,每個(gè)重復(fù)序列由34(或35)個(gè)氨基酸組成,可以識(shí)別并結(jié)合一個(gè)DNA堿基。這種結(jié)構(gòu)使得TALE蛋白可以高度特異地識(shí)別并結(jié)合到特定的DNA序列。TALE基序串聯(lián)成決定靶向性的DNA識(shí)別模塊通過(guò)與FokⅠ結(jié)構(gòu)域連接,就形成了TALEN結(jié)構(gòu)。


    2、TALEN技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)和挑戰(zhàn)

    TALENs的DNA識(shí)別模塊由一系列的轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)物(TALE)基序組成,每個(gè)基序可以識(shí)別并結(jié)合一個(gè)DNA堿基。這種一對(duì)一的識(shí)別模式使得TALENs能夠非常精確地定位到基因組中的特定位置。此外,TALENs使用的FokI核酸酶與ZFNs中的相同,這也保證了TALENs有與ZFNs相當(dāng)?shù)那懈钚省?/span>

    當(dāng)然,TALENs也存在一些局限性。首先,由于TALENs的尺寸要大于ZFNs,因此它們?cè)谀承?yīng)用中可能會(huì)受到限制,例如,較大的尺寸可能會(huì)影響到TALENs在細(xì)胞中的傳遞效率。其次,TALENs的DNA識(shí)別模塊包含大量的重復(fù)序列,這可能會(huì)增加在大腸桿菌中組裝TALENs編碼基因的難度。然而,這些問(wèn)題可以通過(guò)各種策略來(lái)解決,例如使用特殊的組裝方法或改進(jìn)的傳遞系統(tǒng)。

    五、成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列-相關(guān)核酸酶技術(shù)(CRISPR-Cas)

    CRISPR-Cas(成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列-相關(guān)核酸酶)系統(tǒng)是一種在細(xì)菌和古菌中發(fā)現(xiàn)的自然免疫機(jī)制,用于防御病毒和外源質(zhì)粒。目前這個(gè)系統(tǒng)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于基因編輯。

    CRISPR-Cas系統(tǒng)主要由兩個(gè)組成部分構(gòu)成:CRISPR序列和Cas蛋白。

    CRISPR序列:CRISPR是一段DNA序列,由短的重復(fù)序列(repeat)和間隔序列(spacer)組成。重復(fù)序列高度保守,而間隔序列則來(lái)源于過(guò)去入侵的病毒或質(zhì)粒,因此是特異的。

    Cas蛋白:Cas蛋白是一種核酸酶,能夠切割DNA或RNA。Cas蛋白的種類(lèi)很多,其中最著名的是Cas9蛋白,被廣泛用于基因編輯。

    什么是基因編輯技術(shù)?(下)

    CRISPR-Cas系統(tǒng)的工作過(guò)程可以分為三個(gè)階段:

    適應(yīng)階段:當(dāng)病毒或質(zhì)粒入侵時(shí),細(xì)菌或古菌會(huì)從入侵者的基因中切割出一段DNA,然后插入到自己的CRISPR序列中,形成新的間隔序列。


    表達(dá)階段:當(dāng)同樣的病毒或質(zhì)粒再次入侵時(shí),細(xì)菌或古菌會(huì)將CRISPR序列轉(zhuǎn)錄成RNA(稱(chēng)為crRNA)。這些crRNA含有來(lái)自間隔序列的部分,因此可以識(shí)別入侵者的基因序列。


    干擾階段:crRNA會(huì)引導(dǎo)Cas蛋白找到并切割入侵者的基因,從而防止入侵者的復(fù)制。


    CRISPR-Cas系統(tǒng)的原理:

    在CRISPR-Cas9系統(tǒng)中,科學(xué)家們通常將crRNA和另一種名為tracrRNA的RNA被設(shè)計(jì)成一個(gè)單一的導(dǎo)向RNA(sgRNA)。sgRNA可以引導(dǎo)Cas9蛋白精確地切割目標(biāo)基因。

    設(shè)計(jì)sgRNA:首先,需要設(shè)計(jì)一個(gè)sgRNA,它的目標(biāo)序列與你想要編輯的基因序列相配對(duì)。sgRNA通常由一個(gè)20個(gè)核苷酸的目標(biāo)序列和一個(gè)與Cas蛋白結(jié)合的骨架序列組成。


    sgRNA和Cas蛋白的結(jié)合:然后,sgRNA會(huì)結(jié)合到Cas蛋白上,形成一個(gè)sgRNA-Cas復(fù)合體。在這個(gè)復(fù)合體中,sgRNA負(fù)責(zé)識(shí)別目標(biāo)DNA,Cas蛋白負(fù)責(zé)切割DNA。


    DNA識(shí)別和切割:sgRNA-Cas復(fù)合體會(huì)在細(xì)胞中尋找與sgRNA目標(biāo)序列配對(duì)的DNA序列。一旦找到,Cas蛋白就會(huì)在這個(gè)地方切割DNA,產(chǎn)生一個(gè)雙鏈斷裂。


    DNA修復(fù):細(xì)胞會(huì)啟動(dòng)自身的DNA修復(fù)機(jī)制來(lái)修復(fù)這個(gè)雙鏈斷裂。如果在雙鏈斷裂發(fā)生的地方提供一個(gè)含有所需突變的同源模板,那么在修復(fù)過(guò)程中就會(huì)將這個(gè)突變插入到基因中,從而實(shí)現(xiàn)精確的基因編輯。


    什么是基因編輯技術(shù)?(下)

    CRISPR-Cas系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn)是它的操作簡(jiǎn)單,特異性高,可以在任何生物體內(nèi)實(shí)現(xiàn)精確的基因編輯。然而,它也有一些缺點(diǎn),比如可能產(chǎn)生非特異性切割,或者在修復(fù)過(guò)程中產(chǎn)生意外的突變。

    小結(jié)

    基因編輯技術(shù)已經(jīng)在生物科學(xué)研究和應(yīng)用中起到了革命性的作用。從早期的鋅指核酸酶(ZFN)和轉(zhuǎn)錄激活樣效應(yīng)因子核酸酶(TALEN)技術(shù),到現(xiàn)在廣泛應(yīng)用的CRISPR-Cas系統(tǒng),基因編輯技術(shù)的發(fā)展不僅提高了我們對(duì)生命過(guò)程的理解,也為治療遺傳疾病、改良農(nóng)作物和開(kāi)發(fā)新的生物技術(shù)提供了強(qiáng)大的工具。雖然這些技術(shù)都有各自的優(yōu)點(diǎn)和挑戰(zhàn),但是它們的出現(xiàn)無(wú)疑已經(jīng)極大地推動(dòng)了生物科學(xué)的進(jìn)步。相信在未來(lái),隨著基因編輯技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展和優(yōu)化,我們期待能夠看到更多的基因編輯應(yīng)用,從而更好地服務(wù)于人類(lèi)社會(huì)。

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